DNAssist

DNAssist

DNAssistは、シーケンスファイルを表示、編集、分析するための直感的な単一インターフェイスを提供します。ユーザーは、フォント、フォントサイズ、行の長さを選択して、エディターウィンドウの表示をカスタマイズできます。シーケンスは、エディターウィンドウを一番上に表示し、メニューから必要な分析を選択するだけで分析されます。すべての分析は、エディターウィンドウでシーケンスの選択領域で実行することもできます。マウスを右クリックすると、コンテキスト依存のポップアップメニューが表示されます。これにより、ユーザーはほとんどのメニュー項目への便利なショートカットを利用できます。DNAssistで利用できる分析には、次のものがあります。DNA配列の円形と線形の変換DNAのRNAまたはタンパク質配列への変換RNAのDNAまたはタンパク質配列への変換DNA配列のアミノ酸配列への変換1つ、3つ、または6つすべてのフレームでDNAシーケンスのオープンリーディングフレーム(ORF)を特定しますシーケンス内の特定のシーケンスパターンを特定します(これにより、ワイルドカード、ミスマッチ、ギャップが可能になります)特定の転写因子を用いた解析DNA内の強力なヌクレオソームの位置決めシグナルの特定DNA、RNA、またはタンパク質の複数のアライメントの実行核酸またはタンパク質の分子量の取得オリゴヌクレオチドの融解温度の取得タンパク質のpIの計算親水性、疎水性、またはタンパク質の抗原プロファイルモル吸光係数と核酸AciのE0.1%の取得dまたはタンパク質核酸またはタンパク質DNAssistのヌクレオチドまたはアミノ酸組成を取得すると、これらすべての機能が1つの密接に統合されたWindowsアプリケーションに統合されます。分析の結果は結果ウィンドウに表示され、印刷したり、ディスクに保存したり、コピーしてサードパーティのアプリケーションに貼り付けることができます。保存またはコピーされた結果は、表示された形式を保持します。

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商用ライセンスを使用するMacのDNAssistの代替

DNADynamo

DNADynamo

DNADynamo-Windows、OSX、およびLinux用。