Chromas

Chromas

Technelysiumから2つのソフトウェアアプリケーション、ChromasおよびChromasProを入手できます。Chromasは、クロマトグラムをシーケンスするためのシンプルで使いやすいビューアおよびエディタです。Chromasは、複数のシーケンスを組み立てる必要がない最も基本的なシーケンスプロジェクトに最適です。編集したシーケンスをエクスポートしたり、識別のためにBLASTサーバーに送信したりできます。Chromasにはアライメント機能がありません。ChromasProは、配列読み取りのコンティグへのアセンブリ、および制限酵素やオープンリーディングフレームマッピング、BLAST検索などの一般的な配列分析用です。ChromasProは、数メガベースまでのプロジェクトのシーケンス、および基本的なシーケンスの編集と分析に適しています。454およびIlluminaの次世代シーケンサーからのデータをアセンブルできます。2Gb RAMが使用可能な場合、最大100,000のシーケンスを使用できます。また、個々のシーケンスの読み取りを編集することもできます。

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商用ライセンスを使用するMacのChromasの代替

DNADynamo

DNADynamo

DNADynamo-Windows、OSX、およびLinux用。
SimVector

SimVector

SimVectorを使用して、プラスミドマップを描画し、制限分析とマッピングを実行します。