気候変動が惑星を破壊した後、人工の絶滅イベントが地球の表面から人類を一掃しました。数千人の「人類の子孫」だけが、アークスとして知られる地下バンカーに極低温で吊るされた黙示録を生き抜くために厳選されました。何世紀も経ちました。世界は核ホロコーストから回復し、1つを除いてすべてのアークは再開されました— Ark-01。2つのタイムラインで行われます。過去には、ミアとしてプレイします。ミアは、Ark-01に収容された貴重な子孫を生かしておくための管理人であり、施設は彼女の周りで絶えず失敗し、現在は、ドニーとしてプレイします閉じ込められた生き残った子孫を救おうとする捜査官の一人が、地下のアーク複合施設内に埋もれたはるかに大きな陰謀を発見しました。あなたが行うすべての行動と選択は、誰が生き、誰が死ぬかに直接影響し、Ark-01の運命と人類そのものをあなたの手に委ねます。人類を救いますか?それとも私たち全員を破滅させる?...