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「よく文書化されている」機能を備えたアプリ

Unison

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Unisonは、UnixおよびWindows用のファイル同期ツールです。
Vim

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Vim（ "Vi IMproved"）は、構文の強調表示、単語補完を可能にする高度なテキストエディターであり、膨大な量のコンテンツを提供しています。GVimと呼ばれるGUIバージョンもあります。
web2py

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Web2pyは、オープンソースのWebアプリケーションフレームワークです。Web2pyはPython言語で書かれており、Pythonでプログラム可能です。