BioBlenderは、オープンソースの3Dモデリングソフトウェア上に構築されたソフトウェアパッケージです。生物学はナノスケールで動作し、人間の目には見えない物体があります。BioBlenderを使用すると、科学データと最高水準の3D操作に基づいて、細胞に存在するいくつかのキャラクターを表示することができます。世界中の科学者がタンパク質を原子レベルで研究し、公開リポジトリProtein Data Bankに情報を保管します。各分子は、その原子とその3D座標のリストとして記述されます。...、表面を写実的な方法で表示し、既知の立体構造に基づいて精巧なタンパク質の動きを表示します。PDBファイルは、ユーザー定義のディレクトリからロードするか、PDBサイトから直接ダウンロードできます（PDBコードを挿入して）。タンパク質は（原子または分子表面として）3Dで表示され、ユーザーはその表面特性、分子親油性ポテンシャル、静電ポテンシャルを計算して視覚化できます。タンパク質の動きについては、BioBlenderはBlender Game Engineを使用して2つの立体構造間の中間体を計算します。このプログラムは、中間PDBファイルとレンダリングされた画像の両方をムービーとして出力します。BioBlenderは、3Dアニメーション、視覚効果、ビデオゲームのオープンソース、自由に配布されるマルチプラットフォームで相互運用可能なサポートされているプログラムであるBlenderの実装です。3Dコンピュータグラフィックス、ゲームエンジン、科学プログラムの組み合わせにより、BioBlenderはタンパク質の動きを詳しく説明し、テクスチャと粒子の特殊効果に基づく視覚コードを使用して表面の特徴を表示する完全な機器になります。このようにして、動いている分子の物理的および化学的特性を示すことができます。BioBlenderは、ピサ（イタリア）のCNRのSciVisグループによって推進された、さまざまな分野（生物学、化学、物理学、コンピューターサイエンス）の科学者間のコラボレーションの結果です。