GeneStudio Proは、シーケンスフォーマット変換エンジンであるSeqVerter上に構築されたWindowsプラットフォーム用の分子生物学アプリケーションの最新スイートです。したがって、異なる形式のシーケンスを使用したすべての操作は、ユーザーにとってシームレスで透過的です。さらに、GeneStudio Proはインターネット上の分子生物学者が利用できる情報と非常によく統合されています（EntrezとBLASTを使用する前にNCBI免責事項と著作権情報を必ずお読みください）。Entrezの便利なインターフェイスにより、ユーザーはGenBankを検索し、選択した配列を直接配列アライメントまたはコンティグアセンブリプロジェクトに取得できます。BLAST検索は、シーケンスまたはシーケンスの選択したフラグメントを右クリックするだけで実行できます。BLASTの結果は取得され、ユーザーのコンピューターに保存され、いつでも表示できます。GeneStudio Proには、直感的で使いやすいインターフェイスがあります。ほとんどの操作は、ドラッグアンドドロップ操作またはシンプルで整理されたメニューを介して行われます。利用可能なコマンドラインプログラム、Webベースのユーティリティ、またはUNIXマシンからX-Windowsインターフェイスを介してアクセスされるプログラムと比較して、GeneStudio Proは非常に短時間で習得できます。