Zotero

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Zoteroは、無料で使いやすいツールで、研究の収集、整理、引用、共有を支援します。
Zoteroは、無料の使いやすいFirefox / Chrome拡張機能またはスタンドアロンプ​​ログラムであり、300 MBの無料オンラインストレージを使用して、お気に入りのワードプロセッサで研究ソースを直接収集、整理、管理、検索、引用することができます。

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WindowsのZoteroの代替

Qiqqa

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Qiqqaは無料のリサーチおよびリファレンスマネージャーです。PDFを検索、読み取り、注釈を付けます。その後、作業内容を確認して、すぐに書誌事項を作成して作成します。
Mendeley

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Mendeleyは、学術知識の管理と共有を支援します。MendeleyDesktopは、研究論文を整理および共有し、生成するための無料の学術ソフトウェア（Windows、Mac、Linux）です。
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TheBrainは、すべてのWebページ、連絡先、ドキュメント、電子メール、およびファイルをコンテキスト駆動型のビジュアルマップで整理するのに役立ちます。。
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JabRefは、オープンソースの参考文献リファレンスマネージャーです。JabRefが使用するネイティブファイル形式は、標準のLaTeX参考文献形式であるBibTeXです。
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Docearは学術文献管理のユニークなソリューションであり、学術文献の整理、作成、発見に役立ちます。最も特徴的な3つの機能は次のとおりです。
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ReadCubeのデスクトップおよびモバイルiOSアプリケーションは、MacとPCの両方で無料で利用でき、研究者が文献をすばやく見つけてアクセスし、整理することができます。
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科学出版物や学術出版物の作成に使用するテキスト（書籍、記事、またはその他の出版物）からのテキスト引用を整理およびコメントするプログラム。
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SciPlore MindMappingは、マインドマッピングをリファレンスおよびPDF管理と統合することにより、研究者のニーズに焦点を合わせた最初のマインドマッピングツールです。
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PDF Stacksを使用すると、ワンクリックでPDFファイル、論文、研究、ジャーナル記事のコレクションとライブラリを整理、検索、閲覧、検索、注釈付け、共有できます。
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Bibusは書誌データベースです。MySQLまたはSQLiteデータベースを使用して参照を保存します。OpenOfficeに参照を直接挿入できます。